文本相似性计算–MinHash和LSH算法_python

　　给定N个集合，从中找到相似的集合对，如何实现呢？直观的方法是比较任意两个集合。那么可以十分精确的找到每一对相似的集合，但是时间复杂度是O(n²)。此外，假如，N个集合中只有少数几对集合相似，绝大多数集合都不相似，该方法在两两比较过程中“浪费了计算时间”。所以，如果能找到一种算法，将大体上相似的集合聚到一起，缩小比对的范围，这样只用检测较少的集合对，就可以找到绝大多数相似的集合对，大幅度减少时间开销。虽然牺牲了一部分精度，但是如果能够将时间大幅度减少，这种算法还是可以接受的。接下来的内容讲解如何使用Minhash和LSH（Locality-sensitive Hashing）来实现上述目的，在相似的集合较少的情况下，可以在O(n)时间找到大部分相似的集合对。

一、Jaccard相似度

　　判断两个集合是否相等，一般使用称之为Jaccard相似度的算法（后面用Jac(S1,S2)来表示集合S1和S2的Jaccard相似度）。举个列子，集合X = {a,b,c}，Y = {b,c,d}。那么Jac(X,Y) = 2 / 4 = 0.50。也就是说，结合X和Y有50%的元素相同。下面是形式的表述Jaccard相似度公式：

Jac(X,Y) = |X∩Y| / |X∪Y|

　　也就是两个结合交集的个数比上两个集合并集的个数。范围在[0,1]之间。

二、降维技术Minhash

　　原始问题的关键在于计算时间太长。如果能够找到一种很好的方法将原始集合压缩成更小的集合，而且又不失去相似性，那么可以缩短计算时间。Minhash可以帮助我们解决这个问题。举个例子，S₁ = {a,d,e}，S₂ = {c, e}，设全集U = {a,b,c,d,e}。集合可以如下表示：

行号	元素	S₁	S₂	类别
1	a	1	0	Y
2	b	0	0	Z
3	c	0	1	Y
4	d	1	0	Y
5	e	1	1	X

表1

　　表1中，列表示集合，行表示元素，值1表示某个集合具有某个值，0则相反（X，Y，Z的意义后面讨论）。Minhash算法大体思路是：采用一种hash函数，将元素的位置均匀打乱，然后将新顺序下每个集合第一个元素作为该集合的特征值。比如哈希函数h₁(i) = (i + 1) % 5，其中i为行号。作用于集合S₁和S₂，得到如下结果：

行号	元素	S₁	S₂	类别
1	e	1	1	X
2	a	1	0	Y
3	b	0	0	Z
4	c	0	1	Y
5	d	1	0	Y
Minhash		e	e

表2

　　这时，Minhash(S₁) = e，Minhash(S₂) = e。也就是说用元素e表示S₁，用元素e表示集合S₂。那么这样做是否科学呢？进一步，如果Minhash(S₁) 等于Minhash(S₂)，那么S₁是否和S₂类似呢？

　　MinHash的合理性分析

　　首先给出结论，在哈希函数h₁均匀分布的情况下，集合S₁的Minhash值和集合S₂的Minhash值相等的概率等于集合S₁与集合S₂的Jaccard相似度，即：

P(Minhash(S₁) = Minhash(S₂)) = Jac(S₁,S₂)

　　下面简单分析一下这个结论。

　　S₁和S₂的每一行元素可以分为三类：

　　X类均为1。比如表2中的第1行，两个集合都有元素e。

　　Y类一个为1，另一个为0。比如表2中的第2行，表明S₁有元素a，而S₂没有。

　　Z类均为0。比如表2中的第3行，两个集合都没有元素b。

　　这里忽略所有Z类的行，因为此类行对两个集合是否相似没有任何贡献。由于哈希函数将原始行号均匀分布到新的行号，这样可以认为在新的行号排列下，任意一行出现X类的情况的概率为|X|/(|X|+|Y|)。这里为了方便，将任意位置设为第一个出现X类行的行号。所以P(第一个出现X类) = |X|/(|X|+|Y|) = Jac(S₁,S₂)。这里很重要的一点就是要保证哈希函数可以将数值均匀分布，尽量减少冲撞。

　　一般而言，会找出一系列的哈希函数，比如h个（h << |U|），为每一个集合计算h次Minhash值，然后用h个Minhash值组成一个摘要来表示当前集合（注意Minhash的值的位置需要保持一致）。举个列子，还是基于上面的例子，现在又有一个哈希函数h₂(i) = (i -1)% 5。那么得到如下集合：

行号	元素	S₁	S₂	类别
1	b	0	0	Z
2	c	0	1	Y
3	d	1	0	Y
4	e	1	1	X
5	a	1	0	Y
Minhash		d	c

表3

　　所以，现在用摘要表示的原始集合如下：

哈希函数	S₁	S₂
h₁(i) = (i + 1) % 5	e	e
h₂(i) = (i – 1) % 5	d	c

表4

　　从表四还可以得到一个结论，令X表示Minhash摘要后的集合对应行相等的次数（比如表4，X=1，因为哈希函数h₁情况下，两个集合的minhash相等，h₂不等）：

X ~ B(h,Jac(S₁,S₂))

　　X符合次数为h，概率为Jac(S₁,S₂)的二项分布。那么期望E(X) = h * Jac(S₁,S₂) = 2 * 2 / 3 = 1.33。也就是每2个hash计算Minhash摘要，可以期望有1.33元素对应相等。所以，Minhash在压缩原始集合的情况下，保证了集合的相似度没有被破坏。

三、LSH – 局部敏感哈希

　　现在有了原始集合的摘要，但是还是没有解决最初的问题，仍然需要遍历所有的集合对，才能所有相似的集合对，复杂度仍然是O(n²)。所以，接下来描述解决这个问题的核心思想LSH。其基本思路是将相似的集合聚集到一起，减小查找范围，避免比较不相似的集合。仍然是从例子开始，现在有5个集合，计算出对应的Minhash摘要，如下：

	S₁	S₂	S₃	S₄	S₅
区间1	b	b	a	b	a
	c	c	a	c	b
	d	b	a	d	c
区间2	a	e	b	e	d
	b	d	c	f	e
	e	a	d	g	a
区间3	d	c	a	h	b
	a	a	b	b	a
	d	e	a	b	e
区间4	d	a	a	c	b
	b	a	c	b	a
	d	e	a	b	e

表5

　　上面的集合摘要采用了12个不同的hash函数计算出来，然后分成了B = 4个区间。前面已经分析过，任意两个集合（S₁，S₂）对应的Minhash值相等的概率r = Jac(S₁，S₂)。先分析区间1，在这个区间内，P(集合S₁等于集合S₂) = r³。所以只要S₁和S₂的Jaccard相似度越高，在区间1内越有可能完成全一致，反过来也一样。那么P(集合S₁不等于集合S₂) = 1 – r³。现在有4个区间，其他区间与第一个相同，所以P(4个区间上，集合S₁都不等于集合S₂) = (1 – r³)⁴。P(4个区间上，至少有一个区间，集合S₁等于集合S₂) = 1 – (1 – r³)⁴。这里的概率是一个r的函数，形状犹如一个S型，如下：

文本相似性计算--MinHash和LSH算法

图1

　　如果令区间个数为B，每个区间内的行数为C，那么上面的公式可以形式的表示为：

P(B个区间中至少有一个区间中两个结合相等) = 1 – (1 – r^C)^B

　　令r = 0.4，C=3，B = 100。上述公式计算的概率为0.9986585。这表明两个Jaccard相似度为0.4的集合在至少一个区间内冲撞的概率达到了99.9%。根据这一事实，我们只需要选取合适的B和C，和一个冲撞率很低的hash函数，就可以将相似的集合至少在一个区间内冲撞，这样也就达成了本节最开始的目的：将相似的集合放到一起。具体的方法是为B个区间，准备B个hash表，和区间编号一一对应，然后用hash函数将每个区间的部分集合映射到对应hash表里。最后遍历所有的hash表，将冲撞的集合作为候选对象进行比较，找出相识的集合对。整个过程是采用O(n)的时间复杂度，因为B和C均是常量。由于聚到一起的集合相比于整体比较少，所以在这小范围内互相比较的时间开销也可以计算为常量，那么总体的计算时间也是O(n)。

四、代码实现

　　方法一：引用python包datasketch

　　安装：

pip install datasketch

　　使用示例如下：

　　MinHash

from datasketch import MinHash

data1 = ['minhash', 'is', 'a', 'probabilistic', 'data', 'structure', 'for',
        'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'datasets']
data2 = ['minhash', 'is', 'a', 'probability', 'data', 'structure', 'for',
        'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'documents']

m1, m2 = MinHash(), MinHash()
for d in data1:
    m1.update(d.encode('utf8'))
for d in data2:
    m2.update(d.encode('utf8'))
print("Estimated Jaccard for data1 and data2 is", m1.jaccard(m2))

s1 = set(data1)
s2 = set(data2)
actual_jaccard = float(len(s1.intersection(s2)))/float(len(s1.union(s2)))
print("Actual Jaccard for data1 and data2 is", actual_jaccard)

MinHash LSH

from datasketch import MinHash, MinHashLSH

set1 = set(['minhash', 'is', 'a', 'probabilistic', 'data', 'structure', 'for',
            'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'datasets'])
set2 = set(['minhash', 'is', 'a', 'probability', 'data', 'structure', 'for',
            'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'documents'])
set3 = set(['minhash', 'is', 'probability', 'data', 'structure', 'for',
            'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'documents'])

m1 = MinHash(num_perm=128)
m2 = MinHash(num_perm=128)
m3 = MinHash(num_perm=128)
for d in set1:
    m1.update(d.encode('utf8'))
for d in set2:
    m2.update(d.encode('utf8'))
for d in set3:
    m3.update(d.encode('utf8'))

# Create LSH index
lsh = MinHashLSH(threshold=0.5, num_perm=128)
lsh.insert("m2", m2)
lsh.insert("m3", m3)
result = lsh.query(m1)
print("Approximate neighbours with Jaccard similarity > 0.5", result)

MinHash LSH Forest——局部敏感随机投影森林

from datasketch import MinHashLSHForest, MinHash

data1 = ['minhash', 'is', 'a', 'probabilistic', 'data', 'structure', 'for',
        'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'datasets']
data2 = ['minhash', 'is', 'a', 'probability', 'data', 'structure', 'for',
        'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'documents']
data3 = ['minhash', 'is', 'probability', 'data', 'structure', 'for',
        'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'documents']

# Create MinHash objects
m1 = MinHash(num_perm=128)
m2 = MinHash(num_perm=128)
m3 = MinHash(num_perm=128)
for d in data1:
    m1.update(d.encode('utf8'))
for d in data2:
    m2.update(d.encode('utf8'))
for d in data3:
    m3.update(d.encode('utf8'))

# Create a MinHash LSH Forest with the same num_perm parameter
forest = MinHashLSHForest(num_perm=128)

# Add m2 and m3 into the index
forest.add("m2", m2)
forest.add("m3", m3)

# IMPORTANT: must call index() otherwise the keys won't be searchable
forest.index()

# Check for membership using the key
print("m2" in forest)
print("m3" in forest)

# Using m1 as the query, retrieve top 2 keys that have the higest Jaccard
result = forest.query(m1, 2)
print("Top 2 candidates", result)


方法二

minHash源码实现如下：

from random import randint, seed, choice, random
import string
import sys
import itertools

def generate_random_docs(n_docs, max_doc_length, n_similar_docs):
    for i in range(n_docs):
        if n_similar_docs > 0 and i % 10 == 0 and i > 0:
            permuted_doc = list(lastDoc)
            permuted_doc[randint(0,len(permuted_doc))] = choice('1234567890')
            n_similar_docs -= 1
            yield ''.join(permuted_doc)
        else:
            lastDoc = ''.join(choice('aaeioutgrb ') for _ in range(randint(int(max_doc_length*.75), max_doc_length)))
            yield lastDoc

def generate_shingles(doc, shingle_size):
    shingles = set([])
    for i in range(len(doc)-shingle_size+1):
        shingles.add(doc[i:i+shingle_size])
    return shingles

def get_minhash(shingles, n_hashes, random_strings):
    minhash_row = []
    for i in range(n_hashes):
        minhash = sys.maxsize
        for shingle in shingles:
            hash_candidate = abs(hash(shingle + random_strings[i]))
            if hash_candidate < minhash:
                minhash = hash_candidate
        minhash_row.append(minhash)
    return minhash_row

def get_band_hashes(minhash_row, band_size):
    band_hashes = []
    for i in range(len(minhash_row)):
        if i % band_size == 0:                        
            if i > 0:
                band_hashes.append(band_hash)
            band_hash = 0
        band_hash += hash(minhash_row[i])        
    return band_hashes

def get_similar_docs(docs, n_hashes=400, band_size=7, shingle_size=3, collectIndexes=True):
    hash_bands = {}
    random_strings = [str(random()) for _ in range(n_hashes)]
    docNum = 0
    for doc in docs:
        shingles = generate_shingles(doc, shingle_size)
        minhash_row = get_minhash(shingles, n_hashes, random_strings)
        band_hashes = get_band_hashes(minhash_row, band_size)
        
        docMember = docNum if collectIndexes else doc
        for i in range(len(band_hashes)):
            if i not in hash_bands:
                hash_bands[i] = {}
            if band_hashes[i] not in hash_bands[i]:
                hash_bands[i][band_hashes[i]] = [docMember]
            else:
                hash_bands[i][band_hashes[i]].append(docMember)
        docNum += 1

    similar_docs = set()
    for i in hash_bands:
        for hash_num in hash_bands[i]:
            if len(hash_bands[i][hash_num]) > 1:
                for pair in itertools.combinations(hash_bands[i][hash_num], r=2):
                    similar_docs.add(pair) 

    return similar_docs
        
if __name__ == '__main__':
    n_hashes = 200
    band_size = 7
    shingle_size = 3
    n_docs = 1000
    max_doc_length = 40
    n_similar_docs = 10
    seed(42)
    docs = generate_random_docs(n_docs, max_doc_length, n_similar_docs)

    similar_docs = get_similar_docs(docs, n_hashes, band_size, shingle_size, collectIndexes=False)

    print(similar_docs)
    r = float(n_hashes/band_size)
    similarity = (1/r)**(1/float(band_size))
    print("similarity: %f" % similarity)
    print("# Similar Pairs: %d" % len(similar_docs))

    if len(similar_docs) == n_similar_docs:
        print("Test Passed: All similar pairs found.")
    else:
        print("Test Failed.")

参考：

https://www.cnblogs.com/bourneli/archive/2013/04/04/2999767.html

https://blog.csdn.net/weixin_43098787/article/details/82838929

一、Jaccard相似度

二、降维技术Minhash

三、LSH – 局部敏感哈希

四、代码实现

方法一：引用python包datasketch

MinHash

您必须 登录 才能发表评论！

　　方法一：引用python包datasketch

　　MinHash

您必须登录才能发表评论！